Bên cạnh việc nghiên cứu, ứng dụng, mua bản quyền các chương trình tin học tiên tiến, Phòng CNTT còn tự nghiên cứu, sáng tạo các phần mềm chuyên biệt nhằm tăng tính bảo mật trong quá trình sử dụng; tạo ra nhiều ứng dụng hữu ích, góp phần không nhỏ cho sự thay đổi về phương thức lao động, vận dụng sức mạnh của máy móc làm thay đổi cách thức quản trị, điều hành, giảm thiểu thời gian và chi phí sản xuất với các ứng dụng, như: hệ thống quản trị đặt hàng, hệ thống báo cáo sản xuất tiêu thụ, hệ thống cân xuất nhập vật tư sản phẩm, hệ thống in phun đóng bao, quản lý ngân sách, quản lý sửa chữa bảo dưỡng thiết bị, quản lý thuế, nhân sự hệ thống quản lý nguồn nhân lực, hệ thống quản lý văn bản điều hành... 
Đột phá trong quản trị và điều hành tại Vicem Bỉm Sơn trong việc ứng dụng CNTT tại đơn vị là việc triển khai áp dụng dự án hoạch định nguồn lực doanh nghiệp ERP (Enterprice Resource Planing). Đây là một hệ thống phần mềm hiện đại, tiên tiến gồm nhiều phân hệ bao trùm tổng thể hoạt động sản xuất, kinh doanh của doanh nghiệp, mô phỏng quy trình nghiệp vụ các phân hệ, như: sản xuất, tiêu thụ, quản lý mua sắm quản lý kho, kế toán tài chính, nhân sự... đã được nhiều tập đoàn lớn, doanh nghiệp trên thế giới áp dụng. Đây được đánh giá là chiến lược tổng thể về CNTT trong tầm nhìn dài hạn của Vicem Bỉm Sơn và là “xương sống” của CNTT để có thể gắn kết mềm dẻo nhiều bộ phận nghiệp vụ trong công ty thành một khối thông suốt, thống nhất, tích hợp nhiều hệ thống đơn lẻ lại với nhau, quản lý và giám sát số liệu nhanh chóng để đưa ra những quyết định và chiến lược sản xuất, kinh doanh phù hợp.
Vicem Bỉm Sơn là một trong những doanh nghiệp đi đầu trong tỉnh Thanh Hóa triển khai dự án này. Ông Ngô Sỹ Túc, Tổng Giám đốc Vicem Bỉm Sơn đã đánh giá rất cao mục đích và ý nghĩa của dự án; đồng thời, yêu cầu các đơn vị trong toàn công ty bố trí thời gian, tích cực, chủ động học hỏi công nghệ, kiểm tra, rà soát đối chiếu với số liệu thực tế để ứng dụng hiệu quả, đưa dự án ERP vào thực tiễn thành công. Thực tế cho thấy, ứng dụng phần mềm ERP đã giúp đơn vị tăng cường việc quản lý tiêu hao nguyên liệu đầu vào, tính toán chính xác chi phí/tấn sản phẩm, đánh giá được hiệu quả sản xuất, kinh doanh, kiểm soát được chất lượng sản phẩm, thuận lợi trong quá trình tương tác với các nhà phân phối.  
Ông Nguyễn Trung Thực, Phó trưởng Phòng phụ trách Phòng CNTT, Vicem Bỉm Sơn, cho biết, bên cạnh việc tiếp tục hỗ trợ đào tạo cho các bộ phận, nhà phân phối về ứng dụng CNTT trong quản lý bán hàng, nỗ lực cho sự thành công của Dự án ERP, cán bộ, nhân viên Phòng CNTT đang tập trung tiến tới tích hợp những hệ thống vệ tinh đang triển khai trước đó, như hệ thống xây dựng và quản lý ngân sách BMS, hệ thống quản lý sửa chữa, bảo trì thiết bị (Facilio)... vào phần mềm ERP nhằm tăng hiệu quả kết nối thông tin trong điều hành sản xuất, kinh doanh của doanh nghiệp.